-
1 Watson-Crick model
модель Уотсона-Крика, модель двойной спирали ДНКСогласно этой модели молекула ДНК состоит из 2 антипараллельных полинуклеотидных цепей, образующих правозакрученную спираль, удерживаемую взаимодействием пар азотистых оснований в соответствии с правилами комплементарности; на её основе были предсказаны механизм полуконсервативной репликации ДНК semiconservative replication, общий принцип кодирования и траскрипции transcription генетической информации; М.У.-К. предложена Дж.Уотсоном и Ф. Криком в 1953, они же определили количественные характеристики двойной спирали ДНК - диаметр 20, длина полного оборота спирали 34, межнуклеотидное расстояние 3,4.* * *Уотсона-Крика модель, м. двойной спирали ДНК — модель структуры ДНК, предложенная Дж. Уотсоном и Ф. Криком в 1953 г., согласно которой полинуклеотидные цепи закручены в двойную спираль вокруг воображаемой оси. Обе цепи скреплены водородными связями, соединяющими основания, обращенные внутрь спирали. На один виток спирали приходится 10 п. о. Последовательность оснований в двух цепях комплементарна, а направление цепей противоположно (см. Двойная спираль). У.-К. м. стимулировала экспериментальные и теоретические работы, приведшие к бурному развитию молекулярной биологии.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > Watson-Crick model
-
2 wobble hypothesis
гипотеза неоднозначного соответствия, гипотеза «качелей»Гипотеза о возможности неоднозначного спаривания multiple codon recognition первого нуклеотида антикодона anticodon тРНК с третьим нуклеотидом кодона мРНК при трансляции, что допускает возможность нестрогого соответствия нуклеотидов в этом положении; в соответствии с Г.н.с. в этом положении могут образовываться неканонические пары нуклеотидов, не отличающиеся существенно по геометрическим параметрам (Г-У и др.); Г.н.с. объясняет наличие изоакцепторных тРНК isoacceptor tRNAs; предложена Ф. Криком в 1953.* * *Колебания гипотеза, г. «качелей», г. нестрогого соответствия — гипотеза, разработанная для объяснения неоднозначности процесса узнавания и спаривания первого нуклеотида антикодона одной тРНК с третьим нуклеотидом кодона иРНК при трансляции. Антикодон в каждой РНК — триплет оснований. Первые 2 основания иРНК образуют пару согласно законам спаривания оснований, третье основание в антикодоне имеет определенное количество ролей, или колебание, которое позволяет (допускает) нестрогость соответствия и образование пары с любым из оснований в разных кодонах иРНК, занимающих 3-ю позицию. Т. обр., в 3-й позиции будет узнан, напр., А или G, а транспортная РНК с CUU-антикодоном будет также связываться с двумя др. кодонами (GAA или GAG). В соответствии с К. г. могут образовываться неканонические пары нуклеотидов, существенно не отличающиеся по их геометрическим параметрам (G — U и др.). К. г. объясняет наличие изоакцепторных тРНК. Гипотеза предложена Ф. Криком в 1953 г.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > wobble hypothesis
-
3 double helix
двойная спираль [ДНК]Правосторонняя спираль, образованная двумя антипараллельными полинуклеотидными цепями (см. Watson-Crick model.* * *Двойная спираль, с. Уотсона-Крика, дуплекс — модель Уотсона-Крика, описывающая структуру ДНК как спираль, которая образована из двух комплементарных и антипараллельных нитей нуклеиновой кислоты, связанных друг с другом водородными связями. Имеет конфигурацию спирали, закрученной вправо (или влево). Существует несколько возможных конформаций Д. с. (см. ДНК-топология). При В-ДНК конформации, наиболее часто встречающейся in vivo, сахарофосфатный каркас двух связанных водородными связями молекул ДНК располагается на неодинаковом расстоянии вдоль оси спирали и образует т. н. главный (большой) и малый желоба (бороздки). Стерическое расположение атомов в кольцах нуклеотидных оснований большого желоба усиливает водородные связи, что, по-видимому, обеспечивает ДНК-связующим белкам возможность легче присоединяться к основаниям, расположенным в большом желобе (бороздке). Открыта Дж. Уотсоном и Ф. Криком в 1953 г.
Англо-русский толковый словарь генетических терминов > double helix
-
4 duplex
Аутотетраплоидный организм, у которого данный диаллельный ген имеет конституцию ААаа.* * *Двойная спираль, с. Уотсона-Крика, дуплекс — модель Уотсона-Крика, описывающая структуру ДНК как спираль, которая образована из двух комплементарных и антипараллельных нитей нуклеиновой кислоты, связанных друг с другом водородными связями. Имеет конфигурацию спирали, закрученной вправо (или влево). Существует несколько возможных конформаций Д. с. (см. ДНК-топология). При В-ДНК конформации, наиболее часто встречающейся in vivo, сахарофосфатный каркас двух связанных водородными связями молекул ДНК располагается на неодинаковом расстоянии вдоль оси спирали и образует т. н. главный (большой) и малый желоба (бороздки). Стерическое расположение атомов в кольцах нуклеотидных оснований большого желоба усиливает водородные связи, что, по-видимому, обеспечивает ДНК-связующим белкам возможность легче присоединяться к основаниям, расположенным в большом желобе (бороздке). Открыта Дж. Уотсоном и Ф. Криком в 1953 г.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > duplex
-
5 Bioinformatics
Биоинформатика — новое направление исследований, использующее математические и алгоритмические методы для решения молекулярно-биологических задач. В отечественной генетике зарождение этого направления тесно связано со становлением и развитием Института цитологии и генетики СО АН СССР в Новосибирском Академгородке. Первая международная конференция по Б. регуляции и структуры генома в странах СНГ была организована и проведена в этом институте (24–31 августа 1998 г.). Совершенствование экспериментальных методов приводит к экспоненциальному росту молекулярно-биологических данных и возникновению абсолютно новой для биологии междисциплинарной задачи анализа и хранения информации из лабораторий, рассеянных по всему миру. Задачи Б. можно определить как развитие и использование математических и компьютерных методов для решения проблем молекулярной биологии. Выделяют: (1) Задачу поддержания и обновления баз данных. Современная эра в молекулярной биологии началась с момента открытия двойной спирали Уотсоном и Криком в 1953 г. Эта революция породила большой объем данных полученных прямым чтением ДНК из разных участков геномов. Быстрое секвенирование стало возможно 10 лет назад, первый полностью секвенированный геном — геном бактерии Haemophilus influenzae, 1800 т.п.н. В 1996 г. закончено секвенирование первого генома эукариот, генома дрожжей (10 млн п.н.) и секвенирование продолжается со скоростью более 7 миллионов нуклеотидов в год. Знание геномной ДНК в значительной мере сделало возможным ряд фундаментальных биологических открытий, таких как интроны, самосплайсирующиеся РНК (см. РНК-процессинг), обратная транскрипция и псевдогены. Однако существующие базы данных не вполне адекватны требованиям молекулярных биологов: одной из нерешенных проблем является создание программного обеспечения для простого и гибкого доступа к данным. (2) Другой класс задач в большей степени ориентирован на поиск оптимальных алгоритмов для анализа последовательностей. Типичным примером такой задачи является задача выравнивания: как выявить сходство между двумя последовательностями, зная их нуклеотидный состав? Задача решается множество раз в день, поэтому нужен оптимальный алгоритм с минимальным временем выравнивания. (3) Можно также выделить ряд направлений современной Б.: создание и поддержка баз данных (БД) регуляторных последовательностей и белков; БД по регуляции генной экспрессии; БД по генным сетям; компьютерный анализ и моделирование метаболических путей; компьютерные методы анализа и распознавания в геноме регуляторных последовательностей; методы анализа и предсказания активности функциональных сайтов в нуклеотидных последовательностях геномов; компьютерные технологии для изучения генной регуляции; предсказания структуры генов; моделирование транскрипционного и трансляционного контроля генной экспрессии; широкомасштабный геномный анализ и функциональное аннотирование нуклеотидных последовательностей; поиск объективных методов аннотирования и выявления различных сигналов в нуклеотидных последовательностях; эволюция регуляторных последовательностей в геномах; характеристики белковой структуры, связанные с регуляцией; экспериментальные исследования механизмов генной экспрессии и развитие интерфейса, связывающего экспериментальные данные с компьютерным анализом геномов. Первые работы по компьютерному анализу последовательностей биополимеров появились еще в 1960-1970-х годах, однако формирование вычислительной биологии как самостоятельной области началось в 1980-х годах после развития методов массового секвенирования ДНК. С точки зрения биолога-экспериментатора, можно выделить пять направлений вычислительной биологии: непосредственная поддержка эксперимента (физическое картирование (см. Физическая карта), создание контиг (см.) и т.п.), организация и поддержание банков данных, анализ структуры и функции ДНК и белков, эволюционные и филогенетические исследования, а также собственно статистический анализ нуклеотидных последовательностей. Разумеется, границы между этими направлениями в значительной мере условны: результаты распознавания белок-кодирующих областей используются в экспериментах по идентификации генов, одним из основных методов предсказания функции белков является поиск сходных белков в базах данных, а для осуществления детального предсказания клеточной роли белка необходимо привлекать филогенетические соображения. В 1982 г. возникли GenBank и EMBL — основные банки нуклеотидных последовательностей. Вскоре после этого были созданы программы быстрого поиска по банку — FASTA и затем BLAST. Позднее были разработаны методы анализа далеких сходств и выделения функциональных паттернов в белках. Оказалось, что даже при отсутствии близких гомологов, можно достаточно уверенно предсказывать функции белков. Эти методы с успехом применялись при анализе вирусных геномов, а затем и позиционно клонированных генов человека. Алгоритмы анализа функциональных сигналов в ДНК ( промоторов, операторов, сайтов связывания рибосом) менее надежны, однако и они в ряде случаев были успешно применены, напр., при анализе пуринового регулона Escherichia coli. Идет активная работа над созданием алгоритмов предсказания вторичной структуры РНК. Алгоритмические аспекты этой проблемы были разрешены достаточно быстро, однако оказалось, что точность экспериментально определенных физических параметров не позволяет осуществлять надежные предсказания. В то же время, сравнительный подход, позволяющий построить общую структуру для группы родственных или выполняющих одну и ту же функцию РНК, дает существенно более точные результаты. Другим важным достижением, связанным с рибосомальными РНК, стало построение эволюционного древа прокариот и вытекающей из него естественной классификации бактерий, используемой в банках нуклеотидных последовательностей, в частности GenBank. Статистическая информация (в виде предсказания GenScan), последовательности гомологичных белков и последовательности EST являются исходным материалом для предсказания генов в последовательностях ДНК человека программой ААТ. Алгоритмы, объединяющие анализ функциональных сигналов в нуклеотидных последовательностях и предсказание вторичной структуры РНК, используются для поиска генов тРНК и самосплайсирующихся интронов. Одновременный анализ белковых гомологий и функциональных сигналов позволил получить интересные результаты при эволюцию системы репликации по механизму катящегося кольца. Опыт показывает, что надежное предсказание функции белка по аминокислотной последовательности возможно лишь при одновременном применении разнонаправленных программ структурного и функционального анализа. Основное — это приближение теоретических методов к биологической практике. Во-первых, вновь создаваемые алгоритмы все ближе имитируют работу биолога. В частности, был формализован итеративный подход к поиску родственных белков в банках данных, позволяющий работать со слабыми гомологиями и искать отдаленные члены белковых семейств. При этом все члены семейства, идентифицированные на очередном шаге, используются для создания очередного образа семейства, являющегося основой для следующего запроса к базе данных. Другим примером являются алгоритмы, формализующие сравнительный подход к предсказанию вторичной структуры регуляторных РНК. Во-вторых, создаваемые алгоритмы непосредственно приближаются к экспериментальной практике. Так, повышение избирательности методов распознавания белок-кодирующих областей (возможно, за счет уменьшения чувствительности) позволяет осуществлять предсказание специфичных гибридизационных зондов и затравок ПЦР. Наконец, развитие Интернета — электронной почты и затем WWW — сняло зависимость от модели компьютера и операционной системы и сделало программы универсальным рабочим инструментом.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > Bioinformatics
-
6 Watson-Crick helix
Двойная спираль, с. Уотсона-Крика, дуплекс — модель Уотсона-Крика, описывающая структуру ДНК как спираль, которая образована из двух комплементарных и антипараллельных нитей нуклеиновой кислоты, связанных друг с другом водородными связями. Имеет конфигурацию спирали, закрученной вправо (или влево). Существует несколько возможных конформаций Д. с. (см. ДНК-топология). При В-ДНК конформации, наиболее часто встречающейся in vivo, сахарофосфатный каркас двух связанных водородными связями молекул ДНК располагается на неодинаковом расстоянии вдоль оси спирали и образует т. н. главный (большой) и малый желоба (бороздки). Стерическое расположение атомов в кольцах нуклеотидных оснований большого желоба усиливает водородные связи, что, по-видимому, обеспечивает ДНК-связующим белкам возможность легче присоединяться к основаниям, расположенным в большом желобе (бороздке). Открыта Дж. Уотсоном и Ф. Криком в 1953 г.Англо-русский толковый словарь генетических терминов > Watson-Crick helix
-
7 wobble hypothesis
гипотеза неоднозначного соответствия
гипотеза «качелей»
Гипотеза о возможности неоднозначного спаривания первого нуклеотида антикодона тРНК с третьим нуклеотидом кодона мРНК при трансляции, что допускает возможность нестрогого соответствия нуклеотидов в этом положении; в соответствии с Г.н.с. в этом положении могут образовываться неканонические пары нуклеотидов, не отличающиеся существенно по геометрическим параметрам (Г-У и др.); Г.н.с. объясняет наличие изоакцепторных тРНК; предложена Ф. Криком в 1953.
[Арефьев В.А., Лисовенко Л.А. Англо-русский толковый словарь генетических терминов 1995 407с.]Тематики
Синонимы
- гипотеза «качелей»
EN
Англо-русский словарь нормативно-технической терминологии > wobble hypothesis
-
8 Watson-Crick model
модель Уотсона-Крика
модель двойной спирали ДНК
Согласно этой модели молекула ДНК состоит из 2 антипараллельных полинуклеотидных цепей, образующих правозакрученную спираль, удерживаемую взаимодействием пар азотистых оснований в соответствии с правилами комплементарности; на её основе были предсказаны механизм полуконсервативной репликации ДНК, общий принцип кодирования и траскрипции генетической информации; М. У.-К. предложена Дж. Уотсоном и Ф. Криком в 1953, они же определили количественные характеристики двойной спирали ДНК - диаметр 20, длина полного оборота спирали 34, межнуклеотидное расстояние 3,4.
[Арефьев В.А., Лисовенко Л.А. Англо-русский толковый словарь генетических терминов 1995 407с.]Тематики
Синонимы
EN
Англо-русский словарь нормативно-технической терминологии > Watson-Crick model
-
9 Watson, James Dewey
(р. 1928) Уотсон, Джеймс ДьюиБиохимик. Окончил Чикагский университет [ Chicago, University of], в 1950 получил степень доктора в Университете Индианы [ Indiana University]. 25 апреля 1953 совместно с Ф. Криком [Crick, Francis C. H.] опубликовал в английском журнале "Нейчер" короткую статью, в которой излагался результат их многолетней работы по пространственному моделированию двойной спирали ДНК. Это открытие приравнено к крупнейшим открытиям в истории науки. За него авторы в 1962 были удостоены Нобелевской премии по физиологии и медицине. Преподавал в Калифорнийском технологическом институте [ California Institute of Technology], Гарвардском университете [ Harvard University]. С 1968 директор Лаборатории количественной биологии в Колд-Спринг-Харборе, шт. Нью-Йорк [Cold Spring Harbor Laboratory of Quantitative Biology]. В 1988-92 возглавлял Управление исследований генотипа человека [Office for Human Genome Research] Национальных институтов здравоохранения [ National Institutes of Health]. Среди его трудов - "Молекулярная биология гена" ["Molecular Biology of the Gene"] (1965), "Двойная спираль" ["The Double Helix"] (1968, 1980), "История ДНК" ["The DNA Story"] (1981)English-Russian dictionary of regional studies > Watson, James Dewey
См. также в других словарях:
1953 год в науке — 1951 – 1952 1953 1954 – 1955 См. также: Другие события в 1953 году В 1953 году были различные научные и технологические события, некоторые из которых представлены ниже. Содержание 1 События … Википедия
ГОСУДАРЬ — Государи братцы! Арх. Восклицание, выражающее сильное удивление, изумление. СРНГ 7, 99. Государи мои батюшки! Олон. То же, что государи братцы! СРНГ 7, 99. Великий государь. Жарг. шк. Шутл. ирон. Директор школы. Bytic, 1999 2000; Максимов, 57.… … Большой словарь русских поговорок
История молекулярной биологии — Модель структуры ДНК, выполненная Уотсоном и Криком в 1953 г. и реконструированная через 20 лет из оригинальных частей для Музея науки (Лондон) История молекулярной биоло … Википедия
Уотсон Джеймс Дьюи — Уотсон (Watson) Джеймс Дьюи (р. 6.4.1928, Чикаго), американский биохимик, специалист в области молекулярной биологии, член Национальной АН США (1962), Американской академии искусств и наук (1957), Датской королевской АН (1962). Окончил Чикагский… … Большая советская энциклопедия
Уотсон — I Уотсон (Watson) Дейвид Мередит Сирс (18.6.1886, Манчестер, – 23.7.1973), английский палеонтолог, член Лондонского королевского общества (1922; в 1938–39 вице президент). Окончил Манчестерский университет (1907). С 1912 преподавал в… … Большая советская энциклопедия
КОМПЛЕМЕНТАРНОСТЬ — в химии, пространственное соответствие структур двух молекул (разных или одинаковых), благодаря к рому возможно образование между ними водородных связей и осуществление межмол. взаимодействий. В широком смысле также взаимное соответствие… … Химическая энциклопедия
модель двойной спирали ДНК — Watson Crick s model модель Уотсона Крика, модель двойной спирали ДНК. Cогласно этой модели молекула ДНК состоит из 2 антипараллельных полинуклеотидных цепей, образующих правозакрученную спираль, удерживаемую взаимодействием пар азотистых… … Молекулярная биология и генетика. Толковый словарь.
гипотеза качелей — wobble hypothesis гипотеза неоднозначного соответствия, гипотеза качелей . Гипотеза о возможности неоднозначного спаривания <multiple codon recognition> первого нуклеотида антикодона <anticodon> тРНК с третьим нуклеотидом кодона мРНК… … Молекулярная биология и генетика. Толковый словарь.
ГЕНЕТИКА — (от греч. genesis происхождение), наука о наследственности и изменчивости организмов. Начало Г. как науки положил Г, Мендель (1822 84), к рый, скрещивая между собой сорта гороха с качественно различающимися признаками, установил главные… … Ветеринарный энциклопедический словарь
гипотеза неоднозначного соответствия — гипотеза «качелей» Гипотеза о возможности неоднозначного спаривания первого нуклеотида антикодона тРНК с третьим нуклеотидом кодона мРНК при трансляции, что допускает возможность нестрогого соответствия нуклеотидов в этом положении; в … Справочник технического переводчика
модель Уотсона-Крика — модель двойной спирали ДНК Согласно этой модели молекула ДНК состоит из 2 антипараллельных полинуклеотидных цепей, образующих правозакрученную спираль, удерживаемую взаимодействием пар азотистых оснований в соответствии с правилами… … Справочник технического переводчика
